该剧讲述了一群智慧超群、忠诚于国家的国安干警在平凡的日常生活中，发现了一系列可疑事件，并通过高超的侦查技术和对国家、对人民的忠诚与热爱，最终打击了一伙间谍分子的故事。段迎九是厦州市国家安全局的优秀侦查员，他在一次看似普通的失踪案件调查中，发现了一些异常的蛛丝马迹。随后，厦州市国家安全局成立了三号专案组，由段迎九担任临时组长。段迎九召集了大峰、老魏等旧部同事，以及新晋干警黄海、朱慧和丁晓禾等人，组成了老、中、青三代国安干警团队。在段迎九的带领下，团队运用各自的专业技能，通过抽丝剥茧，最终揭露了一桩十多年前的旧案，并成功将藏匿在厦州市的间谍绳之以法。整个行动被命名为“凤凰行动”，代表着国安干警在打击间谍分子的过程中所展现出的勇气和智慧